본 연구소는 기초과학의 연구를 통하여 대학과 국가의 기초과학수준의 향상과 그 응용에 기여하여, 그것을 토대로 고급인력을 양성하며 첨단기술 개발을 목적으로 1981년 3월 1일 영남대학교 부설 기초과학연구소 설치령에 의하여 설립되었다.
본 연구소의 연구부는 수리해석, 통계, 물리, 화학, 생명화학, 생화학연구부와 신물질, 과학교육, 한국자원보전 연구센터로 조직되어 있으며, 연구소원은 영남대학교 이과대학 교수 전원과 기초과학 연구 분야에 관심이 있는 영남대학교 교수로 구성되어 있다.
본 연구소는 연구인력과 능력을 집중화, 체계화하여 적극 지원함으로써 자주적이고 창조적인 연구환경을 조성하고 고급연구인력 양성 배출을 통해 학문의 국제화와 국가산업 발전에 기여할 수 있는 아래에 있는 사업을 계획 추진한다.